Subaru wprowadziło odświeżenie czwartej generacji modelu Legacy w 2006 roku. Choć na pierwszy rzut oka wyglądał on identycznie, subtelne różnice sprawiły, że cała konstrukcja wydawała się bardziej zharmonizowana.
Podczas gdy Impreza przeszła już drugie odświeżenie, zaczynając wyglądać bardziej atrakcyjnie, Legacy było dobrze zaprojektowane. To skłoniło Subaru do przemyślenia, co można zmienić, aby poprawić, ale nie zepsuć wyglądu samochodu. Dodatkowo, zrezygnowano z podstawowego silnika, który był wystarczająco sportowy dla tego pojazdu.
Na pierwszy rzut oka przód samochodu wyglądał identycznie jak w modelu z 2004 roku. Ale tak nie było. Miał łagodniejsze kąty i krawędzie, co zmniejszyło jego agresywny wygląd. Ponadto, zderzak został całkowicie zmieniony i zawierał nowy wlot powietrza na dolnej części oraz środkowy nawiew otoczony pojedynczymi wlotami dla lamp przeciwmgielnych. Tymczasem z tyłu, światła cofania zostały przesunięte w dół na środkowej części pojazdu. Podobnie jak jego poprzednik, Legacy z 2006 roku miał podwójne wydechy dla niektórych wersji silnikowych.
W związku z tym, że klienci skarżyli się na system audio, Subaru zmieniło go na jednostkę z odtwarzaczem CD w desce rozdzielczej. To doprowadziło również do przeprojektowania centralnej konsoli. Ponadto, system nawigacji satelitarnej został umieszczony pomiędzy centralnymi nawiewami w łatwo dostępnym miejscu. Podobnie jak jego poprzednik, miał wzmocnione fotele kubełkowe z przodu, które okazały się przydatne podczas manewrów na dużych prędkościach. Jednak tylna kanapa pozostała bez zmian, była odpowiednia dla dwóch osób i nie miała wystarczająco miejsca na nogi dla trzeciego pasażera siedzącego na środku.