Lincoln wprowadził luksusowego pickupa Mark LT w 2005 roku na rok modelowy 2006, próbując uczynić go bardziej atrakcyjnym za pomocą zmodernizowanej wersji, która pojawiła się w roku modelowym 2009.
Stworzenie ekskluzywnej wersji Forda Expedition i oznaczenie jej jako Lincoln Navigator przyniosło ogromne korzyści amerykańskiej marce luksusowej. W rezultacie marka z niebieskim znakiem rozważała zrobienie czegoś podobnego dla Forda F-150, co doprowadziło do powstania Lincoln Mark LT. Klienci jednak nie byli zbyt chętni do zakupu droższego pojazdu o tej samej platformie i nieco lepszymi funkcjami, więc Mark LT nie sprzedawał się dobrze. Na domiar złego, światowy kryzys finansowy, który rozpoczął się pod koniec 2007 roku, jeszcze bardziej zaszkodził sprzedaży. Zaskakująco jednak, Mark LT odniósł wielki sukces w Meksyku, więc Ford wycofał go z rynku amerykańskiego, kontynuując sprzedaż tam, ale w wersji ulepszonej.
Jedną z najistotniejszych zmian wizualnych w 2009 roku w Lincoln Mark LT była przednia część. Producent zastąpił chłodnicę typu waterfall nową, która nawiązywała do będzie do designu ze skrzydłami swoich pozostałych modeli. Pomiędzy nimi, na pionowym poziomym pasku w kolorze nadwozia, umieszczono chromowaną, wąską i pionową emblemat. Inną znaczącą zmianą były reflektory, które pochodziły z F-150 SVT Raptor. Chromowane wykończenia pozostały na zderzaku, jak w wersji sprzed modernizacji, ale z okrągłymi lampami przeciwmgielnymi zamiast prostokątnych.
Z profilu, producent wprowadził kilka dodatkowych ulepszeń dla Lincoln Mark LT z 2009 roku. Oprócz chromowanych dekoracji na dolnych bokach drzwi, umieszczono również emblemat modelu poniżej. Aby ułatwić wsiadanie i wysiadanie, Lincoln dodał stałe progi pod dolnymi panelami. Podobnie jak jego poprzednik, model z 2009 roku posiadał stałe, chromowane boki wzdłuż górnych krawędzi tylnej skrzyni i opcję zdejmowanej osłony.
Ponieważ Lincoln Mark LT z 2009 roku oparty był na odświeżonej wersji Forda F-150, miał ulepszoną deskę rozdzielczą. Instrumenty składały się z dwóch dużych wskazówek dla prędkościomierza i obrotomierza, które otaczały wyświetlacz TFT. Powyżej znajdowały się wskaźniki ciśnienia oleju, temperatury płynu chłodzącego, poziomu paliwa i temperatury oleju w skrzyni biegów. Połączenie skóry, aluminium i drewna stwarzało luksusową atmosferę wewnątrz pojazdu. Dodatkowo, producent oferował opcję ośmiocalowego ekranu dotykowego dla systemu multimedialnego, z dostępną nawigacją. Z przodu, duże fotele kubełkowe zapewniały doskonały komfort, ale niewiele wsparcia bocznego. Z tyłu, kanapa mogła pomieścić trzech dorosłych, z dużą ilością miejsca na nogi i głowę.