W 2004 roku Audi A3 otrzymało aktualizację, która obejmowała całkowicie nowy przód, dużą atrapę chłodnicy, odświeżone reflektory, nowe zderzaki oraz nowe felgi i wykończenia zewnętrzne. Pięciodrzwiowa wersja została nazwana Sportback, aby odróżnić ją od wersji trzydrzwiowej, nazwanej hatchback.
Druga generacja Audi A3 zadebiutowała na Międzynarodowym Salonie Samochodowym w Genewie w 2003 roku. Opierała się na nowej platformie, a w czerwcu 2004 roku do sprzedaży trafiła wersja Sportback z pięcioma drzwiami. W segmencie hatchback Sportback był jedynym luksusowym samochodem oferującym pięć drzwi. BMW Serii 3 Compact i Mercedes-Benz Sportcoupe były dostępne wyłącznie w wersjach trzydrzwiowych.
Nowy design autorstwa Waltera da Silvy charakteryzował się nową atrapą chłodnicy, wprowadzonej po raz pierwszy w Audi A8 W12. W porównaniu do wersji trzydrzwiowej, A3 Sportback był dłuższy o 80 mm (3,14”), co było wynikiem dłuższego rozstawu osi. Na dachu klient mógł wybrać parę srebrnych belek dachowych. Tył samochodu zyskał nowy zderzak oraz tylne światła w stylu A4. Trzecie światło stop było zamontowane na małym spojlerze dachowym.
Wewnątrz znajdowało się miejsce dla pięciu pasażerów. Był to luksusowy samochód w rozmiarze kompaktowym, który oferował bogate wyposażenie, takie jak automatyczna klimatyzacja oraz nowa półautomatyczna skrzynia biegów. Skórzane siedzenia i sportowe fotele były oferowane jako opcja, lub standard w niektórych modelach.